Алексей Андреевич Бондаренко родился 18 марта 1983 года в Дзержинском районе Москвы (ныне - Мещанский район) в семье инженеров и военнослужащих.
С отличием окончил Российский Государственный медицинский университет.
После получения специальности врача функциональной диагностики работал работал врачом в 137 поликлинике на Протопоповском переулке в Мещанском районе, далее в компании "Медикопром"заведующим отделением.
Ординатура "Организация здравоохранения и общественное здоровье".
Окончил магистратуру МГУУ по специальности "Государственное и муниципальное управление. Стратегическое управление мегаполисом".
Далее работал главным специалистом-врачом в отделе международного сотрудничества ФГБУ ЦНИИОИЗ Минздрава России.
С 2015 года - научный сотрудник-врач Отдела стратегического планирования и мониторинга здравоохранения Федерального НИИ Минздрава России.
Женат.
В политических партиях не состоит. Автор научных публикаций и авторских разработок в области организации здравоохранения, административного права. Участвовал в составе рабочих групп по совершенствованию законодательства "Об основах охраны здоровья граждан", а также в составе рабочих групп по совершенствованию административного законодательства РФ. Действительный член Ассоциации медицинских физиков России.
Увлечения: мотопутешествия, велоспорт.
2012-2017 г. - депутат Мещанскогомуниципального Собрания (Совет депутатов), самовыдвижение. Округ № 2